RECONOCIMIENTOS
Integrante del Programa Institucional de Formación de Investigadores (PIFI) del Instituto Politécnico Nacional. COFAA‑IPN. Octubre 1986 a marzo 1989.
Premio de investigación científica en el área de recursos naturales 1990. Entregado por el Instituto Politécnico Nacional. Al mejor trabajo de investigación original del área de Recursos naturales. Con el trabajo intitulado "Los murciélagos de Chiapas, México". Febrero 1991.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel de Candidato. Julio 1992 a junio 1995.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel de Candidato. Julio 1995 a junio 1996.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel I. Julio 1996 a junio 1999.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel I. Julio 1999 a junio 2002.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel II. Julio 2002 a diciembre 2005.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel II. Enero 2006 a diciembre 2010.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel III. Enero 2011 a diciembre 2015.
Sistema Nacional de Investigadores. Nivel III. Enero 2016 a diciembre 2020.
Otorgamiento de una beca “Faculty Visits competition” por la Universidad de California MEXUS y CONACYT por tres meses para hacer una estancia en el Museum of Vertebrate Zoology, University of California, Berkeley. Noviembre 2002 a febrero 2003.
Curador adjunto de mamíferos. New Mexico Museum of Natural History and Sciences. Desde enero 2003.
Investigador invitado. Museum of Vertebrate Zoology, Universidad de California, campus Berkeley. Desde 2007 la fecha.
Reconocido como especialista de mamíferos de México y asesor de la UICN (2007).
Premio Nacional al Merito Ecológico 2008. Secretaria del Medio Ambiente y Recursos Naturales.
Pronunciamiento por parte del Congreso del Estado de Baja California Sur, como ciudadano destacado del estado y en reconocimiento a la trayectoria de investigación (2008).
Encargado de establecer la Red Temática del CONACYT sobre Código de Barras de La Vida (2008-2009).
Editor General y fundador de la revista Therya. La revista de la Asociación Mexicana de Mastozoología, A. C. (AMMAC), de publicación cuatrimestral (desde 2010 a la fecha).
Primer investigador responsable de la Red Temática del CONACYT sobre Código de Barras de La Vida de México (MEXBOL), coordinando más de ~100 investigadores más de una decena de instituciones y presupuesto de 10 millones de peso (2010 - 2012).
Presidente del Comité editorial del Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. (2011).
Miembro regular de la Academia Mexicana de Ciencias (desde 2011 a la fecha).
Representante de los investigadores en el Consejo Sudcaliforniano de Ciencia y Tecnologia (desde septiembre del 2012 a la fecha).
Codirección de la mejor tesis de doctorado del estado de Baja California Sur en 2012. “Diferencias morfométricas en dos especies de la almeja generosa: Panopea generosa (Gould 1850) y P. globosa (Dall, 1898) y filogenia molecular de cinco especies del genero Panopea”.
Integrante de la Comisiòn externa evaludora de El Colegio de la Frontera Sur (2014-2019).
Beca sabática a la Universidad de California en Berkeley (2014).
Chair de la Latin American Studen Field Research award de la American Society of Mammalogy (2015 - a la fecha).
Chair del Pearson award de la American Society of Mammalogy (2015 - a la fecha).
Nombramiento de Profesor visitante en el Instituto Politécnico Nacional (2016-2019).
Especialista de mamíferos de México y asesor de diagnótico de especies en peligos de extinción para Norte América de la UICN (2019 a la fecha).
“Reserch Associated” en el San Diego Museum of Natural History (2019 a la fecha)
Taxa descritos:
Geomyulichus bassolsi (Servín et al 1992)
Geomyulichus guaycurensis (Servín et al 1992)
Cratogeomys goldmani maculatum (Álvarez and Álvarez‑Castañeda 1996)
Chaetodipus arenarius ramirezpulidoi (Álvarez-Castañeda y Cortés-Calva 2004)
Peromyscus gardneri (Lorenzo et al 2016)
Peromyscus bakeri (Álvarez-Castañeda et al 2019)
Peromyscus carolpattonae (Álvarez-Castañeda et al 2019).